山東中醫藥大學創建于1958年，1978年被確定為全國重點建設的中醫院校，1981年成為山東省重點高校，1996年經原國家教委批準更名為山東中醫藥大學，是教育部本科教學工作水平評估優秀學校、國家“特色重點學科項目”建設高校、山東省首批五所應用基礎型人才培養特色名校之一。
2007年學校由濟南市歷下區主體遷入扁鵲故里——長清，截至2014年5月，總占地1829畝，建筑面積54.5萬平方米，儀器設備總值17087.6萬元，館藏紙質圖書110萬冊、電子圖書47萬冊。學校有3所直屬附屬醫院、11所非直屬附屬醫院、22所教學醫院、50余處臨床教學基地和10家山東省研究生聯合培養基地。
截至2016年5月，學校總占地1829畝，建筑面積54.5萬平方米。學校圖書館館藏紙質圖書187.1萬冊、電子圖書50.9萬冊、古籍善本3萬冊，為山東省古籍重點保護單位。設置14個二級學院，擁有24個本科專業，涉及醫、理、文、工、管、教育等學科門類。
